在第二次新吉恩战争=;=、别名“夏亚的叛乱=(”终结后，地球圈取得了短暂的和` %`:平。这之后3年，宇宙世, 纪0;%09]6年。在工业殖民地“工业7号”上 *进行了一项秘密交涉。+,@内容为－－被认为%是]:?$地球联邦政府暗中操-控的“比斯特#/(财团”将把最高机密“$-^$拉普拉斯之箱”交给. 新吉恩的残+党军“袖付”。另一方面，在[安纳%[#海姆工业专门学校就读的少年巴纳*吉·林克斯遇见了自称为奥黛丽·本的+少女（实为旧吉恩公国次男多兹鲁·扎比^! 之 : 女，+美耐巴=:·扎比）奥黛丽为了制止新的战争-爆[+\发，必)
须组织“拉普拉斯%^之箱”的 =交易.(。^ 巴纳吉在数次帮助奥黛丽之后，逐渐被她所吸引。随后?，地球联邦察觉了这; 起交易，!=并进]?行军=*事介入_.，)_工业殖民地随$ ;*即化为一片火;海。巴纳@吉和同伴一边避难一边寻找着奥黛#丽，而出现在.他面前的是比斯特`财团的当家卡.!@\迪阿斯·-比斯(特。奄奄一息的卡迪阿斯%_将出生的秘密告诉了巴-纳吉*-，并且将箱之钥匙－－“机动战士高
:% 达独角兽”托付\^给\+他。随后，一场围)]]*绕“拉普拉斯之箱”的\战
争开始了……