曾几何时，神秘生物奇.居子入侵太阳^系，致使人类流离失所-，只能乘坐行星般大小的(;巨型飞船希德尼 $娅流? 浪在茫茫宇=_宙中。如)/是过了 漫长的一千年[，而今#:_希德)#?尼娅的,居民们已有 `一百年未曾遭(遇奇居子，不过他_;_们从未:^,放松警惕，培养了_@[一代又一#,[%代操纵]%人(!=形兵器“卫人”的驾驶员@_。某天，居住在地下的青年\谷风长道（逢坂良太配/$ 音）迫于饥饿爬到地面，偷米后被%% 人抓住，后在舰长（大原沙耶香配音）的授意:
下*,成为卫人驾,[驶员第628期的训练生，在这] 里他见到` *了 $+有$)过一面/!?之缘的善良女孩星白闲（洲崎绫配音\_）、友-好的第三性人科户濑伊扎那（丰崎爱生配音^）以及高傲刚愎[%的岐神海苔夫（樱井 孝宏配音）等人。未几，少年们外出执行采集任务，甚至却遭逢百年不见的=!奇居子。沉寂已久的宇#;#宙战争再度拉开帷]幕……本片根据^/!贰瓶勉的漫画原作改编。