21世纪初，人类将多数人留@+在被哥$斯拉蹂躏的地`球上，仅使被选中[的人们乘上!]恒星间移民船·阿拉特拉姆，前- 往能够#移居的“约定- 之地·τ星)e ”。但这一计划失败，人?/类只得再度返回@:地球。而长距离亚空间航行所,引发的时@空歪曲，导-致 人类回到的地方变成了“两万年-.+后的地球”。在这个地[:?球，主人公\
·晴男等人在遭受.(哥斯拉袭击的(]同时，  ?与埃克.^;西弗、比尔沙]  尔\=德两种-族的
异星人+`共同%$:实行谋划@#了`[20年的/[ “对哥斯拉战术:* [”，通过殊死战斗成功击倒了哥斯-]^拉。但
喜悦并未持续多久，深藏地下的$^!真正哥斯拉“`+哥斯拉?·地? 球”现身了。两万年间持续成长生存、身高300米、质量超(
过10万吨，在进化成这种姿态 ]]-的超巨大哥斯拉压倒性的破坏力面前，晴男等人落花流!%*水。拯 .救了晴? %男的是被视为人类的残存者“弗图亚”之民，米亚.)^:娜。弗图亚是他们在- 这个地球首次遇到的.%*,人型生))! 命种族。他们会是人类的子孙吗——。“弗图亚的神::也被@哥斯拉击破，:=如今只剩下?卵。挑战者、抗争\]者，全部被火焰吞噬而消失了”面对这样的他们，,;晴男回应-[?道“这是以人(#类的^#双手夺回地球*的最后机会了”。另一#方,面，比尔沙尔德的指挥]官·加(`]尔格，注意?,到$/[ 弗图亚使用=.的箭头是^+) +由“自律思考金属体·纳米金属”所 制造而欢喜(#。这和21世纪他们在富士@ ?山.麓作为“对哥斯拉决战兵=器”: 所开发、在启动前遭到破坏的“机械哥斯=拉”由同种物\.质_#所构成。这正是当时的开.*发设备至\今仍*+]然.残存的证明;#$——。